A organização dos professores, com a existência do LEM na escola, precisa ser adaptada. De um modo geral, o uso do LEM é possibilitado a todos os professores. Estes, para atuarem no LEM, podem se dirigir, com sua turma, em horários previamente combinados e previstos no programa da escola. Caso haja a opção de um professor ser alocado no LEM, a turma poderá ser dividida, ficando parte com o professor na sala de aula e parte no LEM. Sugere-se que um professor de Matemática se responsabilize pelo espaço, de modo que possa fazer uma síntese das experiências, conversando com os colegas e mantendo a organização adequada do local. A organização dos tempos das turmas e dos docentes dependerá, então, dos objetivos e da organização combinada na equipe.